粪菌移植肠道菌群表观遗传试验

检测项目

1. 菌群全基因组DNA甲基化分析：全基因组重亚硫酸盐测序分析，特定功能基因簇甲基化水平定量，差异甲基化区域鉴定。

2. 菌群组蛋白修饰检测：组蛋白H3K4三甲基化水平分析，组蛋白H3K9乙酰化状态检测，组蛋白修饰与基因表达关联性研究。

3. 菌群非编码RNA表达谱：微生物来源小RNA测序分析，特定长链非编码RNA表达量检测，非编码RNA靶基因预测与验证。

4. 菌群染色质可及性测试：微生物染色质开放性区域测序分析，转录因子结合位点可及性变化检测。

5. 菌群代谢物与表观遗传关联分析：短链脂肪酸浓度检测，胆汁酸代谢谱分析，代谢物对宿主及菌群表观遗传修饰影响的测试。

6. 供体与受体菌群表观遗传匹配度测试：关键功能通路表观遗传特征相似性分析，表观遗传“距离”计算。

7. 菌群抗生素抗性基因表观遗传调控：抗性基因启动子区甲基化状态检测，抗性基因表达与表观修饰的相关性分析。

8. 菌群毒力因子表达调控分析：毒力基因簇表观遗传沉默或激活状态测试，毒力因子表达水平定量。

9. 移植后菌群表观遗传稳定性监测：不同时间点核心菌群表观遗传特征动态追踪，表观遗传漂变分析。

10. 菌群-宿主表观遗传互作初探：菌群代谢物对宿主肠道上皮细胞表观遗传的影响测试，相关性网络构建。

检测范围

供体筛选期粪便样本、受体移植前基线粪便样本、受体移植后多个时间点粪便样本、粪菌移植制备物、模拟移植对照样本、肠道内容物、肠道黏膜菌群样本、特定菌株体外培养物、菌群宏基因组DNA提取物、菌群总RNA提取物

检测设备

1. 高通量测序仪：用于进行全基因组重亚硫酸盐测序和染色质开放性测序，以全面解析DNA甲基化状态和染色质结构；具备长读长和高通量特性，适用于复杂微生物群落分析。

2. 实时荧光定量聚合酶链式反应系统：用于精确定量特定基因的甲基化水平、组蛋白修饰相关基因及非编码RNA的表达量；具有高灵敏度和特异性，可进行绝对定量分析。

3. 色谱-质谱联用仪：用于检测与表观遗传调控相关的菌群代谢物，如短链脂肪酸和胆汁酸；高分辨率质谱可实现对复杂样本中痕量化合物的精准定性与定量。

4. 超声波细胞破碎仪：用于高效裂解微生物细胞，提取高质量的基因组DNA和染色质，确保后续表观遗传学分析的完整性与准确性。

5. 染色质免疫共沉淀自动化工作站：用于自动化完成组蛋白修饰或转录因子结合位点的富集过程，提高实验通量和结果的一致性，减少人为误差。

6. 生物信息学分析服务器：配备高技术表观遗传学分析软件，用于处理海量测序数据，进行差异甲基化分析、富集分析和可视化呈现。

7. 高性能液相色谱仪：用于在质谱检测前对样本中的代谢物或核酸修饰产物进行分离与纯化，提高检测的灵敏度与准确性。

8. 超微量核酸蛋白测定仪：用于精确测量微量核酸样本的浓度与纯度，是确保表观遗传学实验起始物料质量的关键设备。

9. 恒温金属浴与梯度聚合酶链式反应仪：用于完成重亚硫酸盐转化、文库构建及常规聚合酶链式反应扩增等分子生物学步骤，提供精确的温度控制。

10. 超低温冷冻储存箱：用于长期安全保存珍贵的菌群样本、核酸提取物及测序文库，确保生物样本的稳定性与可追溯性。

北京中科光析科学技术研究所【简称：中析研究所】

报告：可出具第三方检测报告(电子版/纸质版)。

检测周期：7~15工作日，可加急。

资质：旗下实验室可出具CMA/CNAS资质报告。

标准测试：严格按国标/行标/企标/国际标准检测。

非标测试：支持定制化试验方案。

售后：报告终身可查，工程师1v1服务。

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望谅解(高校、研究所等性质的个人除外).

CMA/CNAS等证书详情，因时间等不可抗拒因素会发生变更，请咨询在线工程师.